Du könntest explizit die _height_ und _depth_ des Textes in den Knoten angeben:
\documentclass{article}
\usepackage{tikz}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}[node distance=5em,text height=1.5ex,text depth=.25ex]
\node (A) {$A^2$};
\node [right of=A] (AxA) {$A\otimes A$};
\draw [->] (A) edge node [above] {$\scriptstyle\varphi$} (AxA);
\draw[black!20] (A.base) ++(-1,0) -- ++(4,0) ;
\end{tikzpicture}
\end{document}
![Ergebnis][1]
[1]: http://i.imgur.com/LovnI0R.pnghttp://texwelt.de/wissen/upfiles/tikz-pfeil-waagerecht.png
