Die `parskip=true`-Option `parskip=true`- bzw. `parskip=full`-Option wird vom [KOMA-Script-Handbuch][1] (Version 2012-07-22) beschrieben mit
> „Absätze werden durch einen vertikalen Abstand von einer Zeile gekennzeichnet, Absatzenden durch einen Leerraum von mind. ein Geviert (1 em) der Grundschrift am Ende der letzten Zeile.“
Genau dieses `1em` eine Geviert wird uns hier angezeigt. angezeigt; die `minipage` ist am Ende nur eine große Box, die TeX nicht trennen kann, wohin also mit dem Em? Die Zeile mit der `minipage` ist am Ende sogar `\textwidth + 1em` groß.
Möchtest du diese Absatzendenleerraumkennzeichnung ganz allgemein nicht, kannst du die `parskip=full-`-Option verwenden, Absatzenden nicht kennzeichnet.
Es gibt außerdem noch `full+` und `full*`, die mindestens ein Drittel (`+`) bzw. mindestens ein Viertel (`*`) der Zeile als Absatzendenleerraum reserviert.
Gleiches gilt für die `half`-Variante, nur dass hier eben der Absatzabstand eine halbe Zeile hoch ist.
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Intern wird hier von TeX der Skip bzw. KOMA-Script über die Zeile
\setparsizes{\z@}{\baselineskip \@plus .1\baselineskip}{1em \@plus 1fil}%
der `\parfillskip` verwendet und zu `1em plus 1fil` gesetzt (`fil` bedeutet, dass es auch länger als `1em` sein kann).
Für TeX ist die Zeile mit der `minipage` also sogar `\textwidth+1em` groß.
Um die Warnung zu verhindern (und eben kein `\parfillskip` zu haben), solltest du `\KOMAoptions{parskip=full-}` vor der `minipage` verwenden. Selbstverständlich sollte das am besten in einer Gruppe passieren, damit du nicht nach der `minipage` manuell wieder in die vorherige Einstellung wechseln musst.
{\KOMAoptions{parskip=full-}
\begin{minipage}{\textwidth}
Inhalt
\end{minipage}\par}
Oder du definierst gleich eine neue Umgebung, die das automatisch macht und unabhängig von der Einstellung `full` oder `half` ist, sondern eben nur den `\parfillskip` ändert.
## Code
\documentclass[parskip=true,draft]{scrartcl}
\makeatletter
\newenvironment*{Minipage}{\parfillskip\z@\@plus 1fil\relax\minipage}{\endminipage\par}
\makeatother
\begin{document}
\begin{Minipage}{\textwidth}
Inhalt
\end{Minipage}
\end{document}
[1]: http://texdoc.net/texmf-dist/doc/latex/koma-script/scrguide.pdf
