Das Paket [`hyperref`](http://www.ctan.org/pkg/hyperref) kennt die Option `pdfencoding` mit der man ihm mitteilen kann, welche Codierung u. a. die Bookmarks haben. haben sollen. Neben der Einstellung `unicode` gibt es auch die Einstellung `auto`, bei der `hyperref` zunächst die Codierung jedes einzelnen Strings selbst zu ermitteln versucht, um diesen dann in die passende Codierung zu bringen, die für Bookmarks vorgesehen ist. zu bringen. Damit funktioniert es dann auch mit der nativen UTF8-Eingabecodierung von LuaLaTeX:
\documentclass{article}
\usepackage{fontspec}
\usepackage[pdfencoding=auto]{hyperref}
\begin{document}
\section{Äpfel können rollen}
\end{document}
Erzeugt mit LuaLaTeX Lesezeichen, wie folgt:
![Korrekte Lesezeichen][1]
XeLaTeX benötigt die Option übrigens nicht, weil `hyperref` sie selbst aktiviert, wenn es XeLaTeX erkennt (Hinweis stammt von @Ulrike Fischer). Natürlich stört es auch nicht, wenn man die Option selbst angibt. Obiges Beispiel funktioniert daher mit XeLaTeX genauso.
In meinen eigenen Tests hat übrigens `pdfencoding=unicode` oder einfach `unicode` als Option ebenfalls funktioniert. Wie Ulrike bemerkt hat, scheint es aber ältere Versionen des Adobe Readers zu geben, die damit manchmal Probleme haben. Da ich selbst keinen Adobe Reader verwende, kann ich das nicht verifizieren.
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In einigen Foren findet man übrigens stattdessen den Tipp, das Paket [`luainputenc`](http://www.ctan.org/pkg/luainputenc) zu verwenden. Wie schon der Einleitung dessen Anleitung zu entnehmen ist, sollte man das Paket aber nur dann verwenden, wenn man keine andere Wahl hat. Dafür werden in der Anleitung auch nur zwei Fälle genannt:
> 1. Man hat ein altes Dokument, das nicht UTF8-codiert ist, und will dieses aus irgendwelchen Gründen nicht umcodieren.
> 2. Man muss das Paket `fontenc` mit einem 8-Bit-codierten Font verwenden, statt Pakete wie
[`fontspec`](http://www.ctan.org/pkg/fontspec) oder [`luaotfload`](http://www.ctan.org/pkg/luaotfload) und `fontenc` mit der Codierungsoption `EU2` zu verwenden.
Für das Problem der Sonderzeichen in Bookmarks trifft keiner dieser Fälle zu. Da aber ansonsten von der Verwendung von `luainputenc` abgeraten wird, betrachte ich dessen Verwendung für das genannte Problem daher als nicht empfehlenswert.
[1]: http://texwelt.de/wissen/upfiles/test12_1.png
