Auch ich rate davon ab, eine Vorlage zu verwenden. Nur wenige sind wirklich gut kommentiert und die meisten verwenden veraltete Pakete oder schlechten Code. Wenn Pakete unkommentiert eingebunden werden, kann man noch die Anleitung lesen. Von unkommentiertem Code sollte man -- gerade als Anfänger -- die Finger lassen.
Ich bin auch der Meinung, dass man seine Arbeit auch ohne tiefes LaTeX-Wissen aufbauen kann.
Das wichtigste Pakete für mathematischen Satz hast du bereits genannt: `amsmath`. Du kannst auch [`mathtools`][1] verwenden, wenn du noch etwas mehr brauchst. Schau einfach mal in die Anleitung.
Für die Bibliographie solltest du unbedingt [`biblatex`][2] und [`biber`][3] verwenden.
Wenn du Einheiten benutzt solltest du [`siunitx`][4] benutzen und für Tabellen kann ich [`booktabs`][5] empfehlen.
An dieser Stelle höre ich aber auch schon auf, weil mir keine ganz allgemeinen Pakete mehr einfallen, die du unbedingt brauchst. Es kommt eben doch darauf an, was du schreibst. (Schon die letzten beiden braucht bestimmt nicht jeder.) Du kannst mit diesen Paketen aber anfangen zu schreiben und bei Bedarf einfach hier nachfragen, welches Paket für diesen oder jenen Zweck geeignet ist. Wir helfen dir bei der Suche gern.
Zu einem Dokument gehört auch, dass man sich eigene Befehle für das [semantische Markup][9] definiert. Das wirst du aber in keiner Vorlage finden, da es sich eben um _eigene_ Befehle handelt. Schließlich hast du andere Wörter, die du hervorheben willst, als andere.
Wenn du dich trotzdem im Netz auf die Suche machst und eine Vorlage gefunden hast, die dir zusagt, solltest du die Pakete überprüfen. Wenn eines in [`l2tabu`][6] als obsolet befundenen Pakete enthalten ist, ist die Vorlage entweder zu alt oder einfach schlecht. Wenn du das Paket [`nag`][7] einbindest, kann dir auch kein veraltetes Paket entgehen und du musst du nicht selbst suchen, sondern nur das [Log][8] lesen.
lesen. Da auch dieses Paket aber immer wieder aktualisiert werden muss, kann man sich darauf nicht immer verlassen, alle veralteten Pakete erwischt zu haben.
[1]: http://ctan.org/pkg/mathtools
[2]: http://ctan.org/pkg/biblatex
[3]: http://ctan.org/pkg/biber
[4]: http://ctan.org/pkg/siunitx
[5]: http://ctan.org/pkg/booktabs
[6]: http://ctan.org/pkg/l2tabu
[7]: http://ctan.org/pkg/nag
[8]: http://texwelt.de/wissen/fragen/2530/was-sind-hilfsdateien-und-wo-finde-ich-diese
[9]: http://texwelt.de/wissen/fragen/1985/wie-sollte-ich-vorgehen-wenn-ich-bestimmte-arten-von-begriffen-beispielsweise-namen-hervorheben-will
